光绪二十一年（1895），南洲直隶厅境划分为东西南北中五乡，下设109团。

民国3年（1914），行政区划沿清旧制。

民国4年（1915），南县知事公署行政四科会议决定， 撤销原五乡109团，改划为17个区、151个团。

民国19年（1930）正月，南县实行地方自治，重建政区，将原17个区、151个团，并为6个自治区、74个团（亦称乡）、12个区辖镇，并将区、团改用序数名。后团、镇下增设闾，闾之下设部。

1927～1932 年，设一、二、三、四、五个苏维埃区。民国24年（1935）5月，废都、团、闾、部，施行区、乡、保、甲制，原6个区不变，原74个团、12个镇并为27乡、4镇，下设125保、2599甲。

民国 27年（1938）7月，撤区并乡，撤6个区，将原27个乡、4个镇并为16乡1镇，下设182保、1894 甲。

民国29年（1940），将原16乡1镇182保并为10乡1镇、126保，并按乡、镇大小分为甲、乙、丙三等。

1949年8月20日完成划区建设，全县建6个区、75保（均用序数名）。

1950年11月～1952年底，废除保甲，划乡建政，全县设 8 个区、160 个乡、5个乡级镇。

1955年全县设9个区、127个乡、1个区级镇、3个乡级镇、885个行 政村、18个居民委员会、94个居民小组。

1956年6月撤区并乡，设18个乡、5个镇、204 个高级农业社、14个居民委员会、86个居民组。

1958年9月28日，撤销原18个乡、5个镇，建立人民公社，设9个公社、2镇、76个大队、14个居民委员会。1961年3月，调整公社体制，全县设15个公社、2镇、320 个大队、2881个生产队、14个居委会、88个居民小组。

1969年9月，调整公社区划，全县设19个公社、338个大队、3个镇、15个居委会、88个居民小组、1个县农场。

1982年，设19个公社、3个镇、1个县农场、376个大队、4603个生产队、17个居委会、75个居民小组。1985年，基层政权体制改革，全县设14个乡、6个镇、1个县农场、378个村、4414个村民小组、39个居委会、239个居民小组。

2005年12月，农村综合配套改革，全县设12个乡镇：华阁镇、 明山头镇、乌嘴乡、青树嘴镇、茅草街镇、三仙湖镇、中鱼口乡、南洲镇、浪拔湖镇、麻河口镇、武圣宫镇、厂窖镇，385个村、11个社区、36个居委会。

2016年3月，并村改革。2017年8月18日，中鱼口乡撤乡建镇。2019年，全县辖 11个镇、1个乡、34个社区和居委会、132个村民委员会。

2024年，行政区划、乡镇村、居民委员会悉数未变。